Mientras el ŠKODA 130 LR seguía compitiendo en las pistas de rally nacionales en septiembre de 1987, se produjo un considerable cambio de paradigma en la Feria Internacional de Ingeniería de Brno, donde ŠKODA presentó el FAVORIT con gran interés. El moderno hatchback con motor y tren propulsor montados en la parte delantera era un desarrollo completamente nuevo y el fabricante de automóviles checo creía que también tendría fuertes perspectivas de venta en los exigentes mercados de Europa Occidental. En Mladá Boleslav, el equipo empezó a trabajar inmediatamente en una versión de rally, cuyo éxito sería clave para promocionar el nuevo modelo a nivel internacional.

El piloto de fábrica Vladimír Berger desempeñó un papel importante en el desarrollo del vehículo de carreras. Para su puesta a punto, condujo el ŠKODA FAVORIT, que aún no había sido homologado oficialmente, en algunos rallies del campeonato checoslovaco de 1988. La homologación del vehículo se produjo el 1 de enero de 1989 con la matrícula A-5373. El FAVORIT celebró un exitoso debut con los equipos de pilotos Krecek/Motl, Sibera/Gross y Berger/Petera poco después en el tradicional rally de ‘Valašská zima’. El FAVORIT celebró su estreno internacional en el rally finlandés de Hanki, conduciendo hasta la victoria de la categoría con Kalevi Aho al volante. El FAVORIT siguió dominando en los años siguientes, ganando casi todas las carreras de su clase. También se impuso a la competencia en rondas exigentes del WRC como el Rally de Montecarlo, el Rally RAC, el Rally de los 1000 Lagos de Finlandia y el Rally Acrópolis. La racha de victorias del dúo Pavel Sibera/Petr Gross, que ganó su clase cuatro veces seguidas en el Rally de Montecarlo entre 1991 y 1994, fue especialmente impresionante.

En 1993, entraron en vigor nuevas normas con el anuncio del Mundial para vehículos con motores atmosféricos, una cilindrada máxima de dos litros y un eje motriz: la llamada Fórmula 2. En la primera temporada, el equipo de ŠKODA Motorsport terminó en segundo lugar, antes de dejar atrás a numerosos competidores de renombre en el año siguiente y asegurar el título de campeón del mundo en la clase de Fórmula 2.

Como coche de rally de clase A, el ŠKODA FAVORIT tenía un aspecto muy similar al modelo de producción en serie a primera vista, pero era un coche de carreras en toda regla. La rigidez de la carrocería, que estaba hecha de chapa más fina, se veía reforzada por un marco de seguridad certificado. A diferencia de la versión estándar, el techo tenía una trampilla mecánica que mejoraba la ventilación del interior. Sin embargo, las ventanas y los paneles de las puertas eran del modelo de producción en serie. Se eliminaron la tapicería y el asiento trasero, y varias medidas adicionales redujeron el peso en orden de marcha a 750 kilogramos.

El panel de control no se modificó, pero los indicadores y los interruptores se adaptaron y se colocaron de forma que también pudieran ser manejados por el copiloto en caso necesario. La presión de los frenos se dirigía a las ruedas traseras a través de un distribuidor de potencia de frenado, que podía adaptarse en función de las condiciones de la carretera. Un volante deportivo, que los conductores solían llevar consigo de un vehículo a otro, simplificaba el manejo del FAVORIT.

El motor contaba con distribución OHV; en comparación con el motor estándar, la cilindrada aumentó de 1.289,4 a 1.299,6 c.c. Las bielas, las levas y otras piezas eran nuevas. Inicialmente, el motor entregaba 76 kW a 6.500 rpm; posteriormente, gracias a un carburador doble Pierburg, la potencia aumentó a 88 kW a 7.000 rpm. Al principio se utilizaba una caja de cambios de cinco velocidades, pero más tarde se sustituyó por una de seis velocidades con dentado recto. La velocidad máxima del FAVORIT oscilaba entre los 150 y los 210 km/h, dependiendo de la relación de transmisión general.

La carrocería blanca estaba originalmente acabada con rayas rojas y azules, que más tarde dieron paso a un diseño a cuadros con los mismos colores. En 1993 se sustituyó por la «V» verde del signo de la victoria y una franja roja, el emblema actual de los coches RS.

El ŠKODA FAVORIT 136 L/A, que había sido modificado para las carreras, también se mantuvo fuera de las pistas de rally en circuitos y subidas. El FAVORIT 136 L/H, desarrollado en 1989 para las carreras en circuito, era especialmente interesante desde el punto de vista técnico. El motor de cuatro cilindros del 790.16 OHC era un prototipo con una mayor cilindrada de 1.596 c.c. Tenía dos carburadores Weber dobles y generaba 123 kW (167 CV) a 6.500 rpm; el par motor era de 176 Nm a 5.500 rpm. El coche alcanzaba una velocidad máxima de 240 km/h y aceleraba de 0 a 100 km/h en sólo 6 segundos. Posteriormente, el motor se benefició de la inyección directa y la potencia aumentó a 129 kW (175 CV). Entre otros eventos, este ŠKODA FAVORIT modificado compitió en la carrera de 24 horas de Nürburgring, donde el trío Kvaizar/Samohýl/Obermann consiguió la victoria en su categoría.

Aunque el ŠKODA FELICIA, más moderno, sustituyó al ŠKODA FAVORIT en la pista de rallies en 1995, el FAVORIT permaneció en las listas de salida de numerosas carreras durante muchos años como un vehículo deportivo que era a la vez potente y asequible.